1、技術不同

2、信息輸出對象不同

3、功能范圍和會計程序不同

技術不同:目前的會計電算化系統主要是為單功能計算機建立的，因為它在成立之初就受到環境的限制。后來，會計電算化軟件也是在此基礎上發展和完善的，會計是在網絡環境下設計的，其實現的主要手段是計算機網絡和現代通信等新信息技術。

信息輸出對象不同:會計電算化系統主要是為財務部門建立的。設計只考慮財務部門的需要，財務部門輸入會計信息，產出只能由財務部門打印，然后提交給其他機構。會計是企業業務處理和管理信息系統的一個組成部分，其大量數據直接從企業內外的其他系統獲得，產出也依賴于各機構和企業內部的其他系統。企業內外各部門根據授權直接進入系統。

功能范圍和會計程序不同:會計電算化是對人工會計系統的一種改進。是在手工制作的基礎上制作的，所以其會計程序也被手工會計程序所模仿，也被開始了簿記憑證。最后，實現了計算機記錄、轉移和提供經濟業務報告的功能。而會計是為了適應時代的要求。根據現代信息的及時性、準確性和實時性特點制作。它是從管理的角度設計的。具有企業會計、會計信息管理和決策分析等功能，其會計程序是以會計目標為基礎的，按照信息管理和信息技術的原則來實現重組會計流程