1、外形和口感不同。甜蕎麥的顆粒呈現“三棱”角狀非常明顯，吃起來沒有苦味；苦蕎麥的顆粒呈現“三棱”圓潤狀，吃起來略帶苦苦的味道。

2、營養不同。苦蕎所含的生物類黃酮如蘆丁（維生素P）和煙酸（維生素PP）為甜蕎的13、5倍，而燕麥、小麥、大米等禾本科植物不含維生素P，膳食纖維、蛋白質、維生素B2分別為甜蕎的1.6倍、1.65倍、3.16倍。

3、功效不同。苦蕎麥茶含蘆丁，可軟化血管，具有降血脂、降血糖、降血壓，減肥敗毒、清理人體垃圾、激活胰島素分泌等功效。甜蕎麥的莖葉有降壓，止血的功效，適用于高血壓，毛細血管脆弱性出血，防止中風，視網膜出血，肺出血。甜蕎麥的種子有健胃，收斂的功效，用于止虛汗。可以炒香研末，外用收斂止汗，消炎。

4、用途不同。苦蕎麥和甜蕎麥可以作為食物使用，例如人們熟悉的蕎麥茶，做蕎麥茶無疑是大多做成苦蕎茶的“五谷之王”苦蕎麥更好。

5、適用人群不同。苦蕎麥是老弱婦孺皆宜的飲食。由于苦蕎麥含有豐富的維生素E和可溶性膳食纖維，同時還含有煙酸和蘆丁（蕓香甙），蘆丁有降低人體血脂和膽固醇、軟化血管、保護視力和預防腦血管出血的作用，所以對于糖尿病人更為適宜，特別適宜食欲不振、飲食不香、腸胃積滯、慢性泄瀉、出黃汗之人和夏季痧癥者食用。甜蕎麥的莖葉有降壓，止血的功效，適用于高血壓，毛細血管脆弱性出血，防止中風，視網膜出血，肺出血，此類病患者可以多食用。