1、從銀杏種子形狀特征上區分。銀杏種子頭圓而具雙棱的，種后為出雌株，核果頭尖而具三棱的，種后為出雄株，播種育苗時可以此來鑒別。但是銀杏種子育苗一般母樹占百分之九十五以上，而公樹只能占百分之五左右，所以銀杏種子育苗長出來的銀杏樹大多數都是母樹。

2、公銀杏樹的花粉 母銀杏樹的花。從花形態上區分：雄株只長雄花，雌株不開花，只結果。雄株屬先花后葉植物，雄株的花芽飽滿，頂端較平。雌樹直接結出豆型的銀杏果。而雄樹所開的花在四月初能正常開開，花的形狀非常像毛毛蟲，也像我們經常吃的桑心子，而母樹所接結的銀杏果則像一個個小蝌蚪，待公樹的花粉成熟而隨風飄落的時候，就會飄到這些銀杏果跟前，進而達到授粉的目的。

3、從植株形態及生長習性上區分。同齡苗木的比較：雌株常比雄株矮小，但莖干較為粗壯，且橫枝比雄株多而零亂，早春發芽也較雄株晚，但入秋落葉卻比雄株早，而成冠時間較雄株早。

4、枝葉的比較雌株比雄株葉片小而綠，葉片中心缺裂較淺，不到葉中部，雄株葉片中心缺裂深，多超過葉片中部：雄株短枝較短，僅1cm～2cm。雌株短枝由于多年連續結種，可以延伸到10cm以上，所以短枝顯得較長。

5、主枝與主干的夾角比較：雌株主枝與主干的夾角大，可達50°以上，看上去向外平展甚至有時下垂，亂而向四方擴展．雄株主枝與主干的夾角小，大多在30°以內，有的幾近平行于主干生長，挺而向上的枝條看起來比雌株粗壯好看。

6、樹冠的比較雌株樹冠形成常比雄株早，而且樹冠頂平或稍突起，呈卵性或圓頭形，而雄株卻相反。 銀杏是雌雄異株的植物，因為雄株只長雄花，雌株只長雌花，雌雄結合受精后才能結果繁殖，這樣，一個地方如果只有雄株或者只有雌株、銀杏樹是無法繁殖的，因此，種植者要根據需要按合理的雌雄株比例種植，才能達到預期的目的。