1、疏剪

花椒樹的修剪方法有很多，在其結果初期，主要使用疏剪的方式。此時的花椒樹雖然已經結果，但是依舊還在不斷的上長，所以要及時將其枝條從基部開始剪除，一些過密、交叉以及重疊的枝芽也要適當剪掉，讓植株更好的接收到光照，促進結果更好。

2、短截

短截是較為常用的一種修剪方法，主要是要將花椒樹生長過程中過于旺盛、衰老的主枝進行修理，以減少養分消耗，促進新枝生長。基本上要在主枝2/3處進行短截，保留2~3個主枝讓其繼續生長即可。

3、整形修剪

當花椒樹幼苗定植后要在當年或者第二年進行整形修剪，從基干25~30厘米處剪去頂端，以便更多萌發側枝，使樹形更加飽滿，生長旺盛。這時樹苗較為脆弱，修剪宜以輕剪為主，不進行短截，之后從基部萌發的枝條保留5~7個，其余全部剪去。

4、留強去弱

花椒樹生長25年后就會進入衰老期，這時修剪以留強去弱為主，集中養分延長植株的壽命。要將生長過程中一些瘦弱枝、下垂枝以及衰老枝從基部剪除，留下壯枝繼續生長，以便恢復樹勢，重新生長。